Ensamblaje de novo de alta calidad del genoma de la gaviota de lava endémica de Galápagos utilizando tecnologías Oxford Nanopore

La gaviota de lava (Leucophaeus fuliginosus) es una especie endémica de Galápagos y considerada la gaviota más rara del mundo, con una población estimada entre 300 y 600 individuos. Su distribución limitada y su exposición a amenazas como la contaminación y especies introducidas hacen que su conservación sea prioritaria. Sin embargo, hasta ahora no se contaba con información genética completa que permitiera comprender mejor su estado poblacional y sus desafíos a largo plazo. Esta investigación tuvo como objetivo obtener por primera vez el genoma completo de la especie, generando una herramienta clave para fortalecer estudios evolutivos y estrategias de conservación basadas en evidencia científica.

Se recolectó una muestra de sangre de una hembra adulta en Galápagos y se realizó la secuenciación utilizando tecnología portátil de Oxford Nanopore, en el archipiélago. Esta metodología permitió analizar largas secuencias de ADN y reconstruir el genoma a nivel de cromosomas, incluyendo los cromosomas sexuales. 

El equipo realizó procesos de ensamblaje, validación y comparación con otras especies de gaviotas disponibles en bases de datos internacionales. El resultado fue un genoma de alta calidad y gran nivel de completitud, comparable e incluso superior al de otras especies relacionadas.

Este estudio representa un avance significativo para la ciencia y la conservación en Galápagos. Contar con el primer genoma de referencia de la gaviota de lava permitirá evaluar su diversidad genética, comprender mejor su historia evolutiva y apoyar decisiones de manejo informadas. Además, demuestra que es posible desarrollar investigación genética de alto nivel directamente en territorios insulares, fortaleciendo la capacidad científica local y abriendo nuevas oportunidades para proteger las especies del archipiélago.

Lee el articulo completo aquí: https://academic.oup.com/g3journal/advance-article/doi/10.1093/g3journal/jkaf259/8384450

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